{
  "_id": "6a1f2546b401979e7342119b",
  "Package": "waves",
  "Title": "Vis-NIR Spectral Analysis Wrapper",
  "Version": "0.2.7",
  "Authors@R": "c(person(given = \"Jenna\",\nfamily = \"Hershberger\",\nrole = c(\"aut\", \"cre\"),\nemail = \"jmh579@cornell.edu\",\ncomment = c(ORCID = \"0000-0002-3147-6867\")),\nperson(given = \"Michael\",\nfamily = \"Gore\",\nrole = \"ths\"),\nperson(given = \"NSF BREAD IOS-1543958\",\nrole = \"fnd\"))",
  "Maintainer": "Jenna Hershberger <jmh579@cornell.edu>",
  "Description": "Originally designed application in the context of\nresource-limited plant research and breeding programs, 'waves'\nprovides an open-source solution to spectral data processing\nand model development by bringing useful packages together into\na streamlined pipeline.  This package is wrapper for functions\nrelated to the analysis of point visible and near-infrared\nreflectance measurements. It includes visualization, filtering,\naggregation, preprocessing, cross-validation set formation,\nmodel training, and prediction functions to enable open-source\nassociation of spectral and reference data. This package is\ndocumented in a peer-reviewed manuscript in the Plant Phenome\nJournal <doi:10.1002/ppj2.20012>.  Specialized cross-validation\nschemes are described in detail in Jarquín et al. (2017)\n<doi:10.3835/plantgenome2016.12.0130>. Example data is from\nIkeogu et al. (2017) <doi:10.1371/journal.pone.0188918>.",
  "License": "MIT + file LICENSE",
  "URL": "https://GoreLab.github.io/waves/, https://github.com/GoreLab/waves",
  "BugReports": "https://github.com/GoreLab/waves/issues",
  "Encoding": "UTF-8",
  "LazyData": "true",
  "VignetteBuilder": "knitr, rmarkdown",
  "Config/roxygen2/version": "8.0.0",
  "Config/pak/sysreqs": "libabsl-dev libcairo2-dev cmake libfontconfig1-dev\nlibfreetype6-dev libfribidi-dev libgdal-dev gdal-bin\nlibgeos-dev make libharfbuzz-dev libicu-dev libjpeg-dev\nlibpng-dev libtiff-dev libuv1-dev libwebp-dev libxml2-dev\nlibssl-dev libproj-dev libsqlite3-dev libudunits2-dev\nlibx11-dev",
  "Repository": "https://gorelab.r-universe.dev",
  "Date/Publication": "2026-06-02 15:55:21 UTC",
  "RemoteUrl": "https://github.com/gorelab/waves",
  "RemoteRef": "HEAD",
  "RemoteSha": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
  "NeedsCompilation": "no",
  "Packaged": {
    "Date": "2026-06-02 18:42:58 UTC",
    "User": "root"
  },
  "Author": "Jenna Hershberger [aut, cre] (ORCID:\n<https://orcid.org/0000-0002-3147-6867>),\nMichael Gore [ths],\nNSF BREAD IOS-1543958 [fnd]",
  "MD5sum": "26c8f120caf22aacebf2940c0df5dde6",
  "_user": "gorelab",
  "_type": "src",
  "_file": "waves_0.2.7.tar.gz",
  "_fileid": "625a0c81427a039eb23093597d161426b09efbe010a6ffe4a4de3f0c86cc515b",
  "_filesize": 3545344,
  "_sha256": "625a0c81427a039eb23093597d161426b09efbe010a6ffe4a4de3f0c86cc515b",
  "_created": "2026-06-02T18:42:58.000Z",
  "_published": "2026-06-02T18:47:34.601Z",
  "_distro": "noble",
  "_jobs": [
    {
      "job": 79146593665,
      "time": 232,
      "config": "linux-devel-x86_64",
      "r": "4.7.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366877604"
    },
    {
      "job": 79146593664,
      "time": 216,
      "config": "linux-release-x86_64",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366872014"
    },
    {
      "job": 79146593689,
      "time": 170,
      "config": "macos-oldrel-arm64",
      "r": "4.5.3",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366855678"
    },
    {
      "job": 79146593767,
      "time": 132,
      "config": "macos-release-arm64",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366842760"
    },
    {
      "job": 79145706376,
      "time": 285,
      "config": "source",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366793056"
    },
    {
      "job": 79146593726,
      "time": 164,
      "config": "wasm-release",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366853509"
    },
    {
      "job": 79146593777,
      "time": 172,
      "config": "windows-devel",
      "r": "4.7.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366856705"
    },
    {
      "job": 79146593708,
      "time": 175,
      "config": "windows-oldrel",
      "r": "4.5.3",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366857392"
    },
    {
      "job": 79146593698,
      "time": 214,
      "config": "windows-release",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7366871990"
    }
  ],
  "_buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837",
  "_status": "success",
  "_host": "GitHub-Actions",
  "_upstream": "https://github.com/gorelab/waves",
  "_commit": {
    "id": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
    "author": "jmh579 <jmh579@cornell.edu>",
    "committer": "jmh579 <jmh579@cornell.edu>",
    "message": "Prepare 0.2.7 release: update DESCRIPTION, vignette, and cran-comments\n",
    "time": 1780415721
  },
  "_maintainer": {
    "name": "Jenna Hershberger",
    "email": "jmh579@cornell.edu",
    "login": "jmh579",
    "twitter": "@jennahersh",
    "description": "Assistant Professor of Vegetable Breeding and Genetics @HershbergerLab ",
    "uuid": 33294076,
    "orcid": "0000-0002-3147-6867"
  },
  "_registered": true,
  "_dependencies": [
    {
      "package": "R",
      "version": ">= 4.1.0",
      "role": "Depends"
    },
    {
      "package": "caret",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "dplyr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "ggplot2",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "lifecycle",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "magrittr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "pls",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "prospectr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "randomForest",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "readr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "rlang",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "scales",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "spectacles",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "stringr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "tibble",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "tidyr",
      "version": ">= 1.0",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "tidyselect",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "testthat",
      "version": ">= 2.1.0",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "knitr",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "rmarkdown",
      "role": "Suggests"
    }
  ],
  "_owner": "gorelab",
  "_selfowned": true,
  "_usedby": 0,
  "_updates": [
    {
      "week": "2025-44",
      "n": 10
    },
    {
      "week": "2025-46",
      "n": 1
    },
    {
      "week": "2026-21",
      "n": 1
    },
    {
      "week": "2026-22",
      "n": 1
    },
    {
      "week": "2026-23",
      "n": 4
    }
  ],
  "_tags": [
    {
      "name": "v0.2.6",
      "date": "2025-10-31"
    },
    {
      "name": "v0.2.7",
      "date": "2026-06-02"
    }
  ],
  "_stars": 7,
  "_contributors": [
    {
      "user": "jmh579",
      "count": 178,
      "uuid": 33294076
    },
    {
      "user": "l-ramirez-lopez",
      "count": 1,
      "uuid": 5450209
    },
    {
      "user": "olivroy",
      "count": 1,
      "uuid": 52606734
    }
  ],
  "_userbio": {
    "uuid": 11669907,
    "type": "organization",
    "name": "The Gore Lab"
  },
  "_downloads": {
    "count": 167,
    "source": "https://cranlogs.r-pkg.org/downloads/total/last-month/waves"
  },
  "_mentions": 3,
  "_devurl": "https://github.com/gorelab/waves",
  "_pkgdown": "https://GoreLab.github.io/waves/",
  "_searchresults": 55,
  "_rbuild": "4.6.0",
  "_assets": [
    "extra/citation.cff",
    "extra/citation.html",
    "extra/citation.json",
    "extra/citation.txt",
    "extra/contents.json",
    "extra/NEWS.html",
    "extra/NEWS.txt",
    "extra/readme.html",
    "extra/readme.md",
    "extra/waves.html",
    "manual.pdf"
  ],
  "_homeurl": "https://github.com/gorelab/waves",
  "_realowner": "gorelab",
  "_cranurl": true,
  "_releases": [
    {
      "version": "0.1.0",
      "date": "2020-09-17"
    },
    {
      "version": "0.1.1",
      "date": "2021-04-21"
    },
    {
      "version": "0.2.0",
      "date": "2022-01-21"
    },
    {
      "version": "0.2.1",
      "date": "2022-02-03"
    },
    {
      "version": "0.2.2",
      "date": "2022-02-18"
    },
    {
      "version": "0.2.3",
      "date": "2022-03-07"
    },
    {
      "version": "0.2.4",
      "date": "2022-03-29"
    },
    {
      "version": "0.2.5",
      "date": "2023-12-12"
    },
    {
      "version": "0.2.6",
      "date": "2025-10-30"
    },
    {
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02"
    }
  ],
  "_exports": [
    "aggregate_spectra",
    "AggregateSpectra",
    "DoPreprocessing",
    "filter_spectra",
    "FilterSpectra",
    "format_cv",
    "FormatCV",
    "plot_spectra",
    "PlotSpectra",
    "predict_spectra",
    "PredictFromSavedModel",
    "pretreat_spectra",
    "save_model",
    "SaveModel",
    "test_spectra",
    "TestModelPerformance",
    "train_spectra",
    "TrainSpectralModel"
  ],
  "_datasets": [
    {
      "name": "ikeogu.2017",
      "title": "Example vis-NIRS and reference dataset",
      "object": "ikeogu.2017",
      "class": [
        "tbl_df",
        "tbl",
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "study.name",
        "sample.id",
        "DMC.oven",
        "TCC",
        "X350",
        "X351",
        "X352",
        "X353",
        "X354",
        "X355",
        "X356",
        "X357",
        "X358",
        "X359",
        "X360",
        "X361",
        "X362",
        "X363",
        "X364",
        "X365",
        "X366",
        "X367",
        "X368",
        "X369",
        "X370",
        "X371",
        "X372",
        "X373",
        "X374",
        "X375",
        "X376",
        "X377",
        "X378",
        "X379",
        "X380",
        "X381",
        "X382",
        "X383",
        "X384",
        "X385",
        "X386",
        "X387",
        "X388",
        "X389",
        "X390",
        "X391",
        "X392",
        "X393",
        "X394",
        "X395",
        "X396",
        "X397",
        "X398",
        "X399",
        "X400",
        "X401",
        "X402",
        "X403",
        "X404",
        "X405",
        "X406",
        "X407",
        "X408",
        "X409",
        "X410",
        "X411",
        "X412",
        "X413",
        "X414",
        "X415",
        "X416",
        "X417",
        "X418",
        "X419",
        "X420",
        "X421",
        "X422",
        "X423",
        "X424",
        "X425",
        "X426",
        "X427",
        "X428",
        "X429",
        "X430",
        "X431",
        "X432",
        "X433",
        "X434",
        "X435",
        "X436",
        "X437",
        "X438",
        "X439",
        "X440",
        "X441",
        "X442",
        "X443",
        "X444",
        "X445",
        "X446",
        "X447",
        "X448",
        "X449",
        "X450",
        "X451",
        "X452",
        "X453",
        "X454",
        "X455",
        "X456",
        "X457",
        "X458",
        "X459",
        "X460",
        "X461",
        "X462",
        "X463",
        "X464",
        "X465",
        "X466",
        "X467",
        "X468",
        "X469",
        "X470",
        "X471",
        "X472",
        "X473",
        "X474",
        "X475",
        "X476",
        "X477",
        "X478",
        "X479",
        "X480",
        "X481",
        "X482",
        "X483",
        "X484",
        "X485",
        "X486",
        "X487",
        "X488",
        "X489",
        "X490",
        "X491",
        "X492",
        "X493",
        "X494",
        "X495",
        "X496",
        "X497",
        "X498",
        "X499",
        "X500",
        "X501",
        "X502",
        "X503",
        "X504",
        "X505",
        "X506",
        "X507",
        "X508",
        "X509",
        "X510",
        "X511",
        "X512",
        "X513",
        "X514",
        "X515",
        "X516",
        "X517",
        "X518",
        "X519",
        "X520",
        "X521",
        "X522",
        "X523",
        "X524",
        "X525",
        "X526",
        "X527",
        "X528",
        "X529",
        "X530",
        "X531",
        "X532",
        "X533",
        "X534",
        "X535",
        "X536",
        "X537",
        "X538",
        "X539",
        "X540",
        "X541",
        "X542",
        "X543",
        "X544",
        "X545",
        "X546",
        "X547",
        "X548",
        "X549",
        "X550",
        "X551",
        "X552",
        "X553",
        "X554",
        "X555",
        "X556",
        "X557",
        "X558",
        "X559",
        "X560",
        "X561",
        "X562",
        "X563",
        "X564",
        "X565",
        "X566",
        "X567",
        "X568",
        "X569",
        "X570",
        "X571",
        "X572",
        "X573",
        "X574",
        "X575",
        "X576",
        "X577",
        "X578",
        "X579",
        "X580",
        "X581",
        "X582",
        "X583",
        "X584",
        "X585",
        "X586",
        "X587",
        "X588",
        "X589",
        "X590",
        "X591",
        "X592",
        "X593",
        "X594",
        "X595",
        "X596",
        "X597",
        "X598",
        "X599",
        "X600",
        "X601",
        "X602",
        "X603",
        "X604",
        "X605",
        "X606",
        "X607",
        "X608",
        "X609",
        "X610",
        "X611",
        "X612",
        "X613",
        "X614",
        "X615",
        "X616",
        "X617",
        "X618",
        "X619",
        "X620",
        "X621",
        "X622",
        "X623",
        "X624",
        "X625",
        "X626",
        "X627",
        "X628",
        "X629",
        "X630",
        "X631",
        "X632",
        "X633",
        "X634",
        "X635",
        "X636",
        "X637",
        "X638",
        "X639",
        "X640",
        "X641",
        "X642",
        "X643",
        "X644",
        "X645",
        "X646",
        "X647",
        "X648",
        "X649",
        "X650",
        "X651",
        "X652",
        "X653",
        "X654",
        "X655",
        "X656",
        "X657",
        "X658",
        "X659",
        "X660",
        "X661",
        "X662",
        "X663",
        "X664",
        "X665",
        "X666",
        "X667",
        "X668",
        "X669",
        "X670",
        "X671",
        "X672",
        "X673",
        "X674",
        "X675",
        "X676",
        "X677",
        "X678",
        "X679",
        "X680",
        "X681",
        "X682",
        "X683",
        "X684",
        "X685",
        "X686",
        "X687",
        "X688",
        "X689",
        "X690",
        "X691",
        "X692",
        "X693",
        "X694",
        "X695",
        "X696",
        "X697",
        "X698",
        "X699",
        "X700",
        "X701",
        "X702",
        "X703",
        "X704",
        "X705",
        "X706",
        "X707",
        "X708",
        "X709",
        "X710",
        "X711",
        "X712",
        "X713",
        "X714",
        "X715",
        "X716",
        "X717",
        "X718",
        "X719",
        "X720",
        "X721",
        "X722",
        "X723",
        "X724",
        "X725",
        "X726",
        "X727",
        "X728",
        "X729",
        "X730",
        "X731",
        "X732",
        "X733",
        "X734",
        "X735",
        "X736",
        "X737",
        "X738",
        "X739",
        "X740",
        "X741",
        "X742",
        "X743",
        "X744",
        "X745",
        "X746",
        "X747",
        "X748",
        "X749",
        "X750",
        "X751",
        "X752",
        "X753",
        "X754",
        "X755",
        "X756",
        "X757",
        "X758",
        "X759",
        "X760",
        "X761",
        "X762",
        "X763",
        "X764",
        "X765",
        "X766",
        "X767",
        "X768",
        "X769",
        "X770",
        "X771",
        "X772",
        "X773",
        "X774",
        "X775",
        "X776",
        "X777",
        "X778",
        "X779",
        "X780",
        "X781",
        "X782",
        "X783",
        "X784",
        "X785",
        "X786",
        "X787",
        "X788",
        "X789",
        "X790",
        "X791",
        "X792",
        "X793",
        "X794",
        "X795",
        "X796",
        "X797",
        "X798",
        "X799",
        "X800",
        "X801",
        "X802",
        "X803",
        "X804",
        "X805",
        "X806",
        "X807",
        "X808",
        "X809",
        "X810",
        "X811",
        "X812",
        "X813",
        "X814",
        "X815",
        "X816",
        "X817",
        "X818",
        "X819",
        "X820",
        "X821",
        "X822",
        "X823",
        "X824",
        "X825",
        "X826",
        "X827",
        "X828",
        "X829",
        "X830",
        "X831",
        "X832",
        "X833",
        "X834",
        "X835",
        "X836",
        "X837",
        "X838",
        "X839",
        "X840",
        "X841",
        "X842",
        "X843",
        "X844",
        "X845",
        "X846",
        "X847",
        "X848",
        "X849",
        "X850",
        "X851",
        "X852",
        "X853",
        "X854",
        "X855",
        "X856",
        "X857",
        "X858",
        "X859",
        "X860",
        "X861",
        "X862",
        "X863",
        "X864",
        "X865",
        "X866",
        "X867",
        "X868",
        "X869",
        "X870",
        "X871",
        "X872",
        "X873",
        "X874",
        "X875",
        "X876",
        "X877",
        "X878",
        "X879",
        "X880",
        "X881",
        "X882",
        "X883",
        "X884",
        "X885",
        "X886",
        "X887",
        "X888",
        "X889",
        "X890",
        "X891",
        "X892",
        "X893",
        "X894",
        "X895",
        "X896",
        "X897",
        "X898",
        "X899",
        "X900",
        "X901",
        "X902",
        "X903",
        "X904",
        "X905",
        "X906",
        "X907",
        "X908",
        "X909",
        "X910",
        "X911",
        "X912",
        "X913",
        "X914",
        "X915",
        "X916",
        "X917",
        "X918",
        "X919",
        "X920",
        "X921",
        "X922",
        "X923",
        "X924",
        "X925",
        "X926",
        "X927",
        "X928",
        "X929",
        "X930",
        "X931",
        "X932",
        "X933",
        "X934",
        "X935",
        "X936",
        "X937",
        "X938",
        "X939",
        "X940",
        "X941",
        "X942",
        "X943",
        "X944",
        "X945",
        "X946",
        "X947",
        "X948",
        "X949",
        "X950",
        "X951",
        "X952",
        "X953",
        "X954",
        "X955",
        "X956",
        "X957",
        "X958",
        "X959",
        "X960",
        "X961",
        "X962",
        "X963",
        "X964",
        "X965",
        "X966",
        "X967",
        "X968",
        "X969",
        "X970",
        "X971",
        "X972",
        "X973",
        "X974",
        "X975",
        "X976",
        "X977",
        "X978",
        "X979",
        "X980",
        "X981",
        "X982",
        "X983",
        "X984",
        "X985",
        "X986",
        "X987",
        "X988",
        "X989",
        "X990",
        "X991",
        "X992",
        "X993",
        "X994",
        "X995",
        "X996",
        "X997",
        "X998",
        "X999",
        "X1000",
        "X1001",
        "X1002",
        "X1003",
        "X1004",
        "X1005",
        "X1006",
        "X1007",
        "X1008",
        "X1009",
        "X1010",
        "X1011",
        "X1012",
        "X1013",
        "X1014",
        "X1015",
        "X1016",
        "X1017",
        "X1018",
        "X1019",
        "X1020",
        "X1021",
        "X1022",
        "X1023",
        "X1024",
        "X1025",
        "X1026",
        "X1027",
        "X1028",
        "X1029",
        "X1030",
        "X1031",
        "X1032",
        "X1033",
        "X1034",
        "X1035",
        "X1036",
        "X1037",
        "X1038",
        "X1039",
        "X1040",
        "X1041",
        "X1042",
        "X1043",
        "X1044",
        "X1045",
        "X1046",
        "X1047",
        "X1048",
        "X1049",
        "X1050",
        "X1051",
        "X1052",
        "X1053",
        "X1054",
        "X1055",
        "X1056",
        "X1057",
        "X1058",
        "X1059",
        "X1060",
        "X1061",
        "X1062",
        "X1063",
        "X1064",
        "X1065",
        "X1066",
        "X1067",
        "X1068",
        "X1069",
        "X1070",
        "X1071",
        "X1072",
        "X1073",
        "X1074",
        "X1075",
        "X1076",
        "X1077",
        "X1078",
        "X1079",
        "X1080",
        "X1081",
        "X1082",
        "X1083",
        "X1084",
        "X1085",
        "X1086",
        "X1087",
        "X1088",
        "X1089",
        "X1090",
        "X1091",
        "X1092",
        "X1093",
        "X1094",
        "X1095",
        "X1096",
        "X1097",
        "X1098",
        "X1099",
        "X1100",
        "X1101",
        "X1102",
        "X1103",
        "X1104",
        "X1105",
        "X1106",
        "X1107",
        "X1108",
        "X1109",
        "X1110",
        "X1111",
        "X1112",
        "X1113",
        "X1114",
        "X1115",
        "X1116",
        "X1117",
        "X1118",
        "X1119",
        "X1120",
        "X1121",
        "X1122",
        "X1123",
        "X1124",
        "X1125",
        "X1126",
        "X1127",
        "X1128",
        "X1129",
        "X1130",
        "X1131",
        "X1132",
        "X1133",
        "X1134",
        "X1135",
        "X1136",
        "X1137",
        "X1138",
        "X1139",
        "X1140",
        "X1141",
        "X1142",
        "X1143",
        "X1144",
        "X1145",
        "X1146",
        "X1147",
        "X1148",
        "X1149",
        "X1150",
        "X1151",
        "X1152",
        "X1153",
        "X1154",
        "X1155",
        "X1156",
        "X1157",
        "X1158",
        "X1159",
        "X1160",
        "X1161",
        "X1162",
        "X1163",
        "X1164",
        "X1165",
        "X1166",
        "X1167",
        "X1168",
        "X1169",
        "X1170",
        "X1171",
        "X1172",
        "X1173",
        "X1174",
        "X1175",
        "X1176",
        "X1177",
        "X1178",
        "X1179",
        "X1180",
        "X1181",
        "X1182",
        "X1183",
        "X1184",
        "X1185",
        "X1186",
        "X1187",
        "X1188",
        "X1189",
        "X1190",
        "X1191",
        "X1192",
        "X1193",
        "X1194",
        "X1195",
        "X1196",
        "X1197",
        "X1198",
        "X1199",
        "X1200",
        "X1201",
        "X1202",
        "X1203",
        "X1204",
        "X1205",
        "X1206",
        "X1207",
        "X1208",
        "X1209",
        "X1210",
        "X1211",
        "X1212",
        "X1213",
        "X1214",
        "X1215",
        "X1216",
        "X1217",
        "X1218",
        "X1219",
        "X1220",
        "X1221",
        "X1222",
        "X1223",
        "X1224",
        "X1225",
        "X1226",
        "X1227",
        "X1228",
        "X1229",
        "X1230",
        "X1231",
        "X1232",
        "X1233",
        "X1234",
        "X1235",
        "X1236",
        "X1237",
        "X1238",
        "X1239",
        "X1240",
        "X1241",
        "X1242",
        "X1243",
        "X1244",
        "X1245",
        "X1246",
        "X1247",
        "X1248",
        "X1249",
        "X1250",
        "X1251",
        "X1252",
        "X1253",
        "X1254",
        "X1255",
        "X1256",
        "X1257",
        "X1258",
        "X1259",
        "X1260",
        "X1261",
        "X1262",
        "X1263",
        "X1264",
        "X1265",
        "X1266",
        "X1267",
        "X1268",
        "X1269",
        "X1270",
        "X1271",
        "X1272",
        "X1273",
        "X1274",
        "X1275",
        "X1276",
        "X1277",
        "X1278",
        "X1279",
        "X1280",
        "X1281",
        "X1282",
        "X1283",
        "X1284",
        "X1285",
        "X1286",
        "X1287",
        "X1288",
        "X1289",
        "X1290",
        "X1291",
        "X1292",
        "X1293",
        "X1294",
        "X1295",
        "X1296",
        "X1297",
        "X1298",
        "X1299",
        "X1300",
        "X1301",
        "X1302",
        "X1303",
        "X1304",
        "X1305",
        "X1306",
        "X1307",
        "X1308",
        "X1309",
        "X1310",
        "X1311",
        "X1312",
        "X1313",
        "X1314",
        "X1315",
        "X1316",
        "X1317",
        "X1318",
        "X1319",
        "X1320",
        "X1321",
        "X1322",
        "X1323",
        "X1324",
        "X1325",
        "X1326",
        "X1327",
        "X1328",
        "X1329",
        "X1330",
        "X1331",
        "X1332",
        "X1333",
        "X1334",
        "X1335",
        "X1336",
        "X1337",
        "X1338",
        "X1339",
        "X1340",
        "X1341",
        "X1342",
        "X1343",
        "X1344",
        "X1345",
        "X1346",
        "X1347",
        "X1348",
        "X1349",
        "X1350",
        "X1351",
        "X1352",
        "X1353",
        "X1354",
        "X1355",
        "X1356",
        "X1357",
        "X1358",
        "X1359",
        "X1360",
        "X1361",
        "X1362",
        "X1363",
        "X1364",
        "X1365",
        "X1366",
        "X1367",
        "X1368",
        "X1369",
        "X1370",
        "X1371",
        "X1372",
        "X1373",
        "X1374",
        "X1375",
        "X1376",
        "X1377",
        "X1378",
        "X1379",
        "X1380",
        "X1381",
        "X1382",
        "X1383",
        "X1384",
        "X1385",
        "X1386",
        "X1387",
        "X1388",
        "X1389",
        "X1390",
        "X1391",
        "X1392",
        "X1393",
        "X1394",
        "X1395",
        "X1396",
        "X1397",
        "X1398",
        "X1399",
        "X1400",
        "X1401",
        "X1402",
        "X1403",
        "X1404",
        "X1405",
        "X1406",
        "X1407",
        "X1408",
        "X1409",
        "X1410",
        "X1411",
        "X1412",
        "X1413",
        "X1414",
        "X1415",
        "X1416",
        "X1417",
        "X1418",
        "X1419",
        "X1420",
        "X1421",
        "X1422",
        "X1423",
        "X1424",
        "X1425",
        "X1426",
        "X1427",
        "X1428",
        "X1429",
        "X1430",
        "X1431",
        "X1432",
        "X1433",
        "X1434",
        "X1435",
        "X1436",
        "X1437",
        "X1438",
        "X1439",
        "X1440",
        "X1441",
        "X1442",
        "X1443",
        "X1444",
        "X1445",
        "X1446",
        "X1447",
        "X1448",
        "X1449",
        "X1450",
        "X1451",
        "X1452",
        "X1453",
        "X1454",
        "X1455",
        "X1456",
        "X1457",
        "X1458",
        "X1459",
        "X1460",
        "X1461",
        "X1462",
        "X1463",
        "X1464",
        "X1465",
        "X1466",
        "X1467",
        "X1468",
        "X1469",
        "X1470",
        "X1471",
        "X1472",
        "X1473",
        "X1474",
        "X1475",
        "X1476",
        "X1477",
        "X1478",
        "X1479",
        "X1480",
        "X1481",
        "X1482",
        "X1483",
        "X1484",
        "X1485",
        "X1486",
        "X1487",
        "X1488",
        "X1489",
        "X1490",
        "X1491",
        "X1492",
        "X1493",
        "X1494",
        "X1495",
        "X1496",
        "X1497",
        "X1498",
        "X1499",
        "X1500",
        "X1501",
        "X1502",
        "X1503",
        "X1504",
        "X1505",
        "X1506",
        "X1507",
        "X1508",
        "X1509",
        "X1510",
        "X1511",
        "X1512",
        "X1513",
        "X1514",
        "X1515",
        "X1516",
        "X1517",
        "X1518",
        "X1519",
        "X1520",
        "X1521",
        "X1522",
        "X1523",
        "X1524",
        "X1525",
        "X1526",
        "X1527",
        "X1528",
        "X1529",
        "X1530",
        "X1531",
        "X1532",
        "X1533",
        "X1534",
        "X1535",
        "X1536",
        "X1537",
        "X1538",
        "X1539",
        "X1540",
        "X1541",
        "X1542",
        "X1543",
        "X1544",
        "X1545",
        "X1546",
        "X1547",
        "X1548",
        "X1549",
        "X1550",
        "X1551",
        "X1552",
        "X1553",
        "X1554",
        "X1555",
        "X1556",
        "X1557",
        "X1558",
        "X1559",
        "X1560",
        "X1561",
        "X1562",
        "X1563",
        "X1564",
        "X1565",
        "X1566",
        "X1567",
        "X1568",
        "X1569",
        "X1570",
        "X1571",
        "X1572",
        "X1573",
        "X1574",
        "X1575",
        "X1576",
        "X1577",
        "X1578",
        "X1579",
        "X1580",
        "X1581",
        "X1582",
        "X1583",
        "X1584",
        "X1585",
        "X1586",
        "X1587",
        "X1588",
        "X1589",
        "X1590",
        "X1591",
        "X1592",
        "X1593",
        "X1594",
        "X1595",
        "X1596",
        "X1597",
        "X1598",
        "X1599",
        "X1600",
        "X1601",
        "X1602",
        "X1603",
        "X1604",
        "X1605",
        "X1606",
        "X1607",
        "X1608",
        "X1609",
        "X1610",
        "X1611",
        "X1612",
        "X1613",
        "X1614",
        "X1615",
        "X1616",
        "X1617",
        "X1618",
        "X1619",
        "X1620",
        "X1621",
        "X1622",
        "X1623",
        "X1624",
        "X1625",
        "X1626",
        "X1627",
        "X1628",
        "X1629",
        "X1630",
        "X1631",
        "X1632",
        "X1633",
        "X1634",
        "X1635",
        "X1636",
        "X1637",
        "X1638",
        "X1639",
        "X1640",
        "X1641",
        "X1642",
        "X1643",
        "X1644",
        "X1645",
        "X1646",
        "X1647",
        "X1648",
        "X1649",
        "X1650",
        "X1651",
        "X1652",
        "X1653",
        "X1654",
        "X1655",
        "X1656",
        "X1657",
        "X1658",
        "X1659",
        "X1660",
        "X1661",
        "X1662",
        "X1663",
        "X1664",
        "X1665",
        "X1666",
        "X1667",
        "X1668",
        "X1669",
        "X1670",
        "X1671",
        "X1672",
        "X1673",
        "X1674",
        "X1675",
        "X1676",
        "X1677",
        "X1678",
        "X1679",
        "X1680",
        "X1681",
        "X1682",
        "X1683",
        "X1684",
        "X1685",
        "X1686",
        "X1687",
        "X1688",
        "X1689",
        "X1690",
        "X1691",
        "X1692",
        "X1693",
        "X1694",
        "X1695",
        "X1696",
        "X1697",
        "X1698",
        "X1699",
        "X1700",
        "X1701",
        "X1702",
        "X1703",
        "X1704",
        "X1705",
        "X1706",
        "X1707",
        "X1708",
        "X1709",
        "X1710",
        "X1711",
        "X1712",
        "X1713",
        "X1714",
        "X1715",
        "X1716",
        "X1717",
        "X1718",
        "X1719",
        "X1720",
        "X1721",
        "X1722",
        "X1723",
        "X1724",
        "X1725",
        "X1726",
        "X1727",
        "X1728",
        "X1729",
        "X1730",
        "X1731",
        "X1732",
        "X1733",
        "X1734",
        "X1735",
        "X1736",
        "X1737",
        "X1738",
        "X1739",
        "X1740",
        "X1741",
        "X1742",
        "X1743",
        "X1744",
        "X1745",
        "X1746",
        "X1747",
        "X1748",
        "X1749",
        "X1750",
        "X1751",
        "X1752",
        "X1753",
        "X1754",
        "X1755",
        "X1756",
        "X1757",
        "X1758",
        "X1759",
        "X1760",
        "X1761",
        "X1762",
        "X1763",
        "X1764",
        "X1765",
        "X1766",
        "X1767",
        "X1768",
        "X1769",
        "X1770",
        "X1771",
        "X1772",
        "X1773",
        "X1774",
        "X1775",
        "X1776",
        "X1777",
        "X1778",
        "X1779",
        "X1780",
        "X1781",
        "X1782",
        "X1783",
        "X1784",
        "X1785",
        "X1786",
        "X1787",
        "X1788",
        "X1789",
        "X1790",
        "X1791",
        "X1792",
        "X1793",
        "X1794",
        "X1795",
        "X1796",
        "X1797",
        "X1798",
        "X1799",
        "X1800",
        "X1801",
        "X1802",
        "X1803",
        "X1804",
        "X1805",
        "X1806",
        "X1807",
        "X1808",
        "X1809",
        "X1810",
        "X1811",
        "X1812",
        "X1813",
        "X1814",
        "X1815",
        "X1816",
        "X1817",
        "X1818",
        "X1819",
        "X1820",
        "X1821",
        "X1822",
        "X1823",
        "X1824",
        "X1825",
        "X1826",
        "X1827",
        "X1828",
        "X1829",
        "X1830",
        "X1831",
        "X1832",
        "X1833",
        "X1834",
        "X1835",
        "X1836",
        "X1837",
        "X1838",
        "X1839",
        "X1840",
        "X1841",
        "X1842",
        "X1843",
        "X1844",
        "X1845",
        "X1846",
        "X1847",
        "X1848",
        "X1849",
        "X1850",
        "X1851",
        "X1852",
        "X1853",
        "X1854",
        "X1855",
        "X1856",
        "X1857",
        "X1858",
        "X1859",
        "X1860",
        "X1861",
        "X1862",
        "X1863",
        "X1864",
        "X1865",
        "X1866",
        "X1867",
        "X1868",
        "X1869",
        "X1870",
        "X1871",
        "X1872",
        "X1873",
        "X1874",
        "X1875",
        "X1876",
        "X1877",
        "X1878",
        "X1879",
        "X1880",
        "X1881",
        "X1882",
        "X1883",
        "X1884",
        "X1885",
        "X1886",
        "X1887",
        "X1888",
        "X1889",
        "X1890",
        "X1891",
        "X1892",
        "X1893",
        "X1894",
        "X1895",
        "X1896",
        "X1897",
        "X1898",
        "X1899",
        "X1900",
        "X1901",
        "X1902",
        "X1903",
        "X1904",
        "X1905",
        "X1906",
        "X1907",
        "X1908",
        "X1909",
        "X1910",
        "X1911",
        "X1912",
        "X1913",
        "X1914",
        "X1915",
        "X1916",
        "X1917",
        "X1918",
        "X1919",
        "X1920",
        "X1921",
        "X1922",
        "X1923",
        "X1924",
        "X1925",
        "X1926",
        "X1927",
        "X1928",
        "X1929",
        "X1930",
        "X1931",
        "X1932",
        "X1933",
        "X1934",
        "X1935",
        "X1936",
        "X1937",
        "X1938",
        "X1939",
        "X1940",
        "X1941",
        "X1942",
        "X1943",
        "X1944",
        "X1945",
        "X1946",
        "X1947",
        "X1948",
        "X1949",
        "X1950",
        "X1951",
        "X1952",
        "X1953",
        "X1954",
        "X1955",
        "X1956",
        "X1957",
        "X1958",
        "X1959",
        "X1960",
        "X1961",
        "X1962",
        "X1963",
        "X1964",
        "X1965",
        "X1966",
        "X1967",
        "X1968",
        "X1969",
        "X1970",
        "X1971",
        "X1972",
        "X1973",
        "X1974",
        "X1975",
        "X1976",
        "X1977",
        "X1978",
        "X1979",
        "X1980",
        "X1981",
        "X1982",
        "X1983",
        "X1984",
        "X1985",
        "X1986",
        "X1987",
        "X1988",
        "X1989",
        "X1990",
        "X1991",
        "X1992",
        "X1993",
        "X1994",
        "X1995",
        "X1996",
        "X1997",
        "X1998",
        "X1999",
        "X2000",
        "X2001",
        "X2002",
        "X2003",
        "X2004",
        "X2005",
        "X2006",
        "X2007",
        "X2008",
        "X2009",
        "X2010",
        "X2011",
        "X2012",
        "X2013",
        "X2014",
        "X2015",
        "X2016",
        "X2017",
        "X2018",
        "X2019",
        "X2020",
        "X2021",
        "X2022",
        "X2023",
        "X2024",
        "X2025",
        "X2026",
        "X2027",
        "X2028",
        "X2029",
        "X2030",
        "X2031",
        "X2032",
        "X2033",
        "X2034",
        "X2035",
        "X2036",
        "X2037",
        "X2038",
        "X2039",
        "X2040",
        "X2041",
        "X2042",
        "X2043",
        "X2044",
        "X2045",
        "X2046",
        "X2047",
        "X2048",
        "X2049",
        "X2050",
        "X2051",
        "X2052",
        "X2053",
        "X2054",
        "X2055",
        "X2056",
        "X2057",
        "X2058",
        "X2059",
        "X2060",
        "X2061",
        "X2062",
        "X2063",
        "X2064",
        "X2065",
        "X2066",
        "X2067",
        "X2068",
        "X2069",
        "X2070",
        "X2071",
        "X2072",
        "X2073",
        "X2074",
        "X2075",
        "X2076",
        "X2077",
        "X2078",
        "X2079",
        "X2080",
        "X2081",
        "X2082",
        "X2083",
        "X2084",
        "X2085",
        "X2086",
        "X2087",
        "X2088",
        "X2089",
        "X2090",
        "X2091",
        "X2092",
        "X2093",
        "X2094",
        "X2095",
        "X2096",
        "X2097",
        "X2098",
        "X2099",
        "X2100",
        "X2101",
        "X2102",
        "X2103",
        "X2104",
        "X2105",
        "X2106",
        "X2107",
        "X2108",
        "X2109",
        "X2110",
        "X2111",
        "X2112",
        "X2113",
        "X2114",
        "X2115",
        "X2116",
        "X2117",
        "X2118",
        "X2119",
        "X2120",
        "X2121",
        "X2122",
        "X2123",
        "X2124",
        "X2125",
        "X2126",
        "X2127",
        "X2128",
        "X2129",
        "X2130",
        "X2131",
        "X2132",
        "X2133",
        "X2134",
        "X2135",
        "X2136",
        "X2137",
        "X2138",
        "X2139",
        "X2140",
        "X2141",
        "X2142",
        "X2143",
        "X2144",
        "X2145",
        "X2146",
        "X2147",
        "X2148",
        "X2149",
        "X2150",
        "X2151",
        "X2152",
        "X2153",
        "X2154",
        "X2155",
        "X2156",
        "X2157",
        "X2158",
        "X2159",
        "X2160",
        "X2161",
        "X2162",
        "X2163",
        "X2164",
        "X2165",
        "X2166",
        "X2167",
        "X2168",
        "X2169",
        "X2170",
        "X2171",
        "X2172",
        "X2173",
        "X2174",
        "X2175",
        "X2176",
        "X2177",
        "X2178",
        "X2179",
        "X2180",
        "X2181",
        "X2182",
        "X2183",
        "X2184",
        "X2185",
        "X2186",
        "X2187",
        "X2188",
        "X2189",
        "X2190",
        "X2191",
        "X2192",
        "X2193",
        "X2194",
        "X2195",
        "X2196",
        "X2197",
        "X2198",
        "X2199",
        "X2200",
        "X2201",
        "X2202",
        "X2203",
        "X2204",
        "X2205",
        "X2206",
        "X2207",
        "X2208",
        "X2209",
        "X2210",
        "X2211",
        "X2212",
        "X2213",
        "X2214",
        "X2215",
        "X2216",
        "X2217",
        "X2218",
        "X2219",
        "X2220",
        "X2221",
        "X2222",
        "X2223",
        "X2224",
        "X2225",
        "X2226",
        "X2227",
        "X2228",
        "X2229",
        "X2230",
        "X2231",
        "X2232",
        "X2233",
        "X2234",
        "X2235",
        "X2236",
        "X2237",
        "X2238",
        "X2239",
        "X2240",
        "X2241",
        "X2242",
        "X2243",
        "X2244",
        "X2245",
        "X2246",
        "X2247",
        "X2248",
        "X2249",
        "X2250",
        "X2251",
        "X2252",
        "X2253",
        "X2254",
        "X2255",
        "X2256",
        "X2257",
        "X2258",
        "X2259",
        "X2260",
        "X2261",
        "X2262",
        "X2263",
        "X2264",
        "X2265",
        "X2266",
        "X2267",
        "X2268",
        "X2269",
        "X2270",
        "X2271",
        "X2272",
        "X2273",
        "X2274",
        "X2275",
        "X2276",
        "X2277",
        "X2278",
        "X2279",
        "X2280",
        "X2281",
        "X2282",
        "X2283",
        "X2284",
        "X2285",
        "X2286",
        "X2287",
        "X2288",
        "X2289",
        "X2290",
        "X2291",
        "X2292",
        "X2293",
        "X2294",
        "X2295",
        "X2296",
        "X2297",
        "X2298",
        "X2299",
        "X2300",
        "X2301",
        "X2302",
        "X2303",
        "X2304",
        "X2305",
        "X2306",
        "X2307",
        "X2308",
        "X2309",
        "X2310",
        "X2311",
        "X2312",
        "X2313",
        "X2314",
        "X2315",
        "X2316",
        "X2317",
        "X2318",
        "X2319",
        "X2320",
        "X2321",
        "X2322",
        "X2323",
        "X2324",
        "X2325",
        "X2326",
        "X2327",
        "X2328",
        "X2329",
        "X2330",
        "X2331",
        "X2332",
        "X2333",
        "X2334",
        "X2335",
        "X2336",
        "X2337",
        "X2338",
        "X2339",
        "X2340",
        "X2341",
        "X2342",
        "X2343",
        "X2344",
        "X2345",
        "X2346",
        "X2347",
        "X2348",
        "X2349",
        "X2350",
        "X2351",
        "X2352",
        "X2353",
        "X2354",
        "X2355",
        "X2356",
        "X2357",
        "X2358",
        "X2359",
        "X2360",
        "X2361",
        "X2362",
        "X2363",
        "X2364",
        "X2365",
        "X2366",
        "X2367",
        "X2368",
        "X2369",
        "X2370",
        "X2371",
        "X2372",
        "X2373",
        "X2374",
        "X2375",
        "X2376",
        "X2377",
        "X2378",
        "X2379",
        "X2380",
        "X2381",
        "X2382",
        "X2383",
        "X2384",
        "X2385",
        "X2386",
        "X2387",
        "X2388",
        "X2389",
        "X2390",
        "X2391",
        "X2392",
        "X2393",
        "X2394",
        "X2395",
        "X2396",
        "X2397",
        "X2398",
        "X2399",
        "X2400",
        "X2401",
        "X2402",
        "X2403",
        "X2404",
        "X2405",
        "X2406",
        "X2407",
        "X2408",
        "X2409",
        "X2410",
        "X2411",
        "X2412",
        "X2413",
        "X2414",
        "X2415",
        "X2416",
        "X2417",
        "X2418",
        "X2419",
        "X2420",
        "X2421",
        "X2422",
        "X2423",
        "X2424",
        "X2425",
        "X2426",
        "X2427",
        "X2428",
        "X2429",
        "X2430",
        "X2431",
        "X2432",
        "X2433",
        "X2434",
        "X2435",
        "X2436",
        "X2437",
        "X2438",
        "X2439",
        "X2440",
        "X2441",
        "X2442",
        "X2443",
        "X2444",
        "X2445",
        "X2446",
        "X2447",
        "X2448",
        "X2449",
        "X2450",
        "X2451",
        "X2452",
        "X2453",
        "X2454",
        "X2455",
        "X2456",
        "X2457",
        "X2458",
        "X2459",
        "X2460",
        "X2461",
        "X2462",
        "X2463",
        "X2464",
        "X2465",
        "X2466",
        "X2467",
        "X2468",
        "X2469",
        "X2470",
        "X2471",
        "X2472",
        "X2473",
        "X2474",
        "X2475",
        "X2476",
        "X2477",
        "X2478",
        "X2479",
        "X2480",
        "X2481",
        "X2482",
        "X2483",
        "X2484",
        "X2485",
        "X2486",
        "X2487",
        "X2488",
        "X2489",
        "X2490",
        "X2491",
        "X2492",
        "X2493",
        "X2494",
        "X2495",
        "X2496",
        "X2497",
        "X2498",
        "X2499",
        "X2500"
      ],
      "rows": 175,
      "table": true,
      "tojson": true
    }
  ],
  "_help": [
    {
      "page": "aggregate_spectra",
      "title": "Aggregate data based on grouping variables and a user-provided function",
      "topics": [
        "aggregate_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "filter_spectra",
      "title": "Filter spectral data frame based on Mahalanobis distance",
      "topics": [
        "filter_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "format_cv",
      "title": "Format multiple trials with or without overlapping genotypes into training and test sets according to user-provided cross validation scheme",
      "topics": [
        "format_cv"
      ]
    },
    {
      "page": "ikeogu.2017",
      "title": "Example vis-NIRS and reference dataset",
      "topics": [
        "ikeogu.2017"
      ]
    },
    {
      "page": "plot_spectra",
      "title": "Plot spectral data, highlighting outliers as identified using Mahalanobis distance",
      "topics": [
        "plot_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "predict_spectra",
      "title": "Use provided model object to predict trait values with input dataset",
      "topics": [
        "predict_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "pretreat_spectra",
      "title": "Pretreat spectral data according to user-designated method",
      "topics": [
        "pretreat_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "save_model",
      "title": "Save spectral prediction model and model performance statistics",
      "topics": [
        "save_model"
      ]
    },
    {
      "page": "test_spectra",
      "title": "Test the performance of spectral models",
      "topics": [
        "test_spectra"
      ]
    },
    {
      "page": "train_spectra",
      "title": "Train a model based predict reference values with spectral data",
      "topics": [
        "train_spectra"
      ]
    }
  ],
  "_pkglogo": "https://github.com/gorelab/waves/raw/HEAD/logo.png",
  "_readme": "https://github.com/gorelab/waves/raw/HEAD/README.md",
  "_rundeps": [
    "askpass",
    "base64enc",
    "baseline",
    "BiasedUrn",
    "bit",
    "bit64",
    "bslib",
    "cachem",
    "caret",
    "class",
    "classInt",
    "cli",
    "clipr",
    "clock",
    "codetools",
    "cpp11",
    "crayon",
    "data.table",
    "DBI",
    "diagram",
    "digest",
    "dplyr",
    "e1071",
    "epiR",
    "evaluate",
    "farver",
    "fastmap",
    "flextable",
    "fontawesome",
    "fontBitstreamVera",
    "fontLiberation",
    "fontquiver",
    "foreach",
    "fs",
    "future",
    "future.apply",
    "gdtools",
    "generics",
    "ggplot2",
    "globals",
    "glue",
    "gower",
    "gtable",
    "hardhat",
    "highr",
    "hms",
    "htmltools",
    "ipred",
    "isoband",
    "iterators",
    "jquerylib",
    "jsonlite",
    "KernSmooth",
    "knitr",
    "labeling",
    "lattice",
    "lava",
    "lifecycle",
    "listenv",
    "lubridate",
    "magrittr",
    "MASS",
    "mathjaxr",
    "Matrix",
    "memoise",
    "mime",
    "ModelMetrics",
    "nlme",
    "nnet",
    "numDeriv",
    "officer",
    "openssl",
    "pander",
    "parallelly",
    "pillar",
    "pkgconfig",
    "pls",
    "plyr",
    "prettyunits",
    "pROC",
    "prodlim",
    "progress",
    "progressr",
    "prospectr",
    "proxy",
    "purrr",
    "R6",
    "ragg",
    "randomForest",
    "rappdirs",
    "RColorBrewer",
    "Rcpp",
    "RcppArmadillo",
    "readr",
    "recipes",
    "reshape2",
    "rlang",
    "rmarkdown",
    "rpart",
    "s2",
    "S7",
    "sass",
    "scales",
    "sf",
    "shape",
    "signal",
    "SparseM",
    "sparsevctrs",
    "spectacles",
    "SQUAREM",
    "stringi",
    "stringr",
    "survival",
    "sys",
    "systemfonts",
    "textshaping",
    "tibble",
    "tidyr",
    "tidyselect",
    "timechange",
    "timeDate",
    "tinytex",
    "tzdb",
    "units",
    "utf8",
    "uuid",
    "vctrs",
    "viridisLite",
    "vroom",
    "withr",
    "wk",
    "xfun",
    "xml2",
    "yaml",
    "zip",
    "zoo"
  ],
  "_vignettes": [
    {
      "source": "waves.Rmd",
      "filename": "waves.html",
      "title": "waves",
      "engine": "knitr::rmarkdown",
      "headings": [
        "Introduction",
        "Use",
        "Installation",
        "1. Format your data",
        "2. Visualize spectra with plot_spectra()",
        "3. Perform outlier removal with filter_spectra().",
        "4. Aggregate scans",
        "5. Evaluate the predictive ability of your spectra",
        "5.1. Pretreat spectra",
        "5.2. Specify a cross-validation scheme",
        "5.3. Train spectral prediction models",
        "5.4. Output",
        "6. Save trained prediction models with save_model()",
        "7. Predict phenotypic values with new spectra",
        "Perform predictions!",
        "How did we do?",
        "Plot predictions"
      ],
      "created": "2022-02-03 01:21:32",
      "modified": "2026-06-02 15:55:21",
      "commits": 5
    }
  ],
  "_score": 6.761551988564182,
  "_indexed": true,
  "_nocasepkg": "waves",
  "_universes": [
    "gorelab",
    "jmh579"
  ],
  "_binaries": [
    {
      "r": "4.7.0",
      "os": "linux",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:46:04.000Z",
      "distro": "noble",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "1170b29a8e51636e7cd4e8afdb2b0bcdf5c04199e7093e059f668c0db3d58850",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "linux",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:45:46.000Z",
      "distro": "noble",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "6af9b4646b3e6f82f96f12516f3fb027c74905981b3968332fa921d3d97778a7",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.5.3",
      "os": "mac",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:45:13.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "a8df68540699f57995afabda07cd68180a29058f0819d7b32fc8e73ae1c4ca00",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "mac",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:44:50.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "c61a286f95ecd957ad7cb1832c5b66ddeeec71724d0637647525cf9ec74484ed",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "wasm",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:46:06.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "957b94fc5a0f26dcd270dcce33e6e50614266cc902272282f19441a7c8feaffc",
      "status": "success",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.7.0",
      "os": "win",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:44:37.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "46486f86bc6d4086820db26047bba134e7af5c09c5eaa671473c69ac4006610f",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.5.3",
      "os": "win",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:44:47.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "202066226ec8c033d26cbf7a22800009f87a91e56d24555a71e845f80798bb26",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "win",
      "version": "0.2.7",
      "date": "2026-06-02T18:45:24.000Z",
      "commit": "45e526b7be08574a212a99de5477effe5c3e389d",
      "fileid": "deb0481874f8f3a637771cc402455590335d37ed008a76f8b5f4786db4860e81",
      "status": "success",
      "check": "OK",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/gorelab/actions/runs/26840407837"
    }
  ]
}